SIBYLLE
VERSION 1.2


La librairie Ferret de visualisation des modèles utilisés au CERFACS









Cette librairie regroupe certains scripts développés dans l'équipe Global Change par la très active communauté des utilisateurs Ferret (Carole Cibot, Claire Delon, Marie Drévillon, Andrea Piacentini et Driss Bari). Elle s'appuie sur la librairie de scripts standard Ferret et la librairie Fast, developpée à l'IPSL par Patrick Brockman. Elle utilise un programme de triangulation de Michel Déqué (CNRM) ainsi que le logiciel de couplage du Cerfacs (OASIS Version 3 en mode interpolateur) développé par Sophie Valcke, Damien Déclat et Arnaud Caubel. Merci également à Olivier Marti (LSCE).

Faites remonter vos remarques et communiquez vos nouveaux scripts (Eric.Maisonnave@ cerfacs.fr).
Au Cerfacs, les codes sources se trouvent sur mon HOME:

            dans /home/evian/eric/Sibylle. 

Ils sont également disponibles sur le site ftp du Cerfacs:

            ftp://ftp.cerfacs.fr/pub/globc/exchanges/maisonna/Sibylle_1.2.tar 

ainsi que via CVS:

CVSROOT=:pserver:maisonna@elnino.cerfacs.fr:2401/home/evian/ROOTCVS


L'arborescence est organisée comme suit:

Sibylle/



Data/
Fichiers netcdf de grilles, poids. Namcouple oasis pour interpolation. Fichier .sib de traits de côtes

Ext_func/
 bin/
 Exécutables fortran et scripts shell


lib/
 Fichiers objets issus de la compilation des programmes fortran


src/
 Programmes fortran. Script de compilation

Go/
Scripts ferret

Palette/
Palettes ferret

scripts exferret et exferret_bash



Note: la librairie est perpétuellement en cours de développement. La page Web (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Sibylle/Sibylle_doc_1_2.html) sera tenue à jour en fonction des nouveaux scripts et de vos remarques.

Une version papier de cette page est disponible (version 1.2).


Nouveautés:

La librairie Sibylle est désormais disponible sur PC. Elle a été enrichie de nouveaux scripts Ferret, et elle utilise aussi des programmes externes fortran (ou scripts shell).

Une nouvelle grille est visualisable (la grille stretchée d'Arpege). Toutes les échéances temporelles d'un fichier en grille réduite Arpege sont désormais plus facilement manipulables grâce à leur interpolation par le logiciel OASIS Version 3 et leur sauvegarde dans un fichier Netcdf. D'autres modifications enrichissent la mise en forme des données visualisées.


Configuration:

La version Ferret5.41 (ou Ferret5.51 sur linux) a été installée sur toutes les stations de travail du Cerfacs, les PC Linux, ainsi que sur l'Alphaserver Compaq "imhotep". Elle est indispensable pour pouvoir visualiser des champs de vecteurs sur les grilles non regulières ORCA et Arpege BT42.
 

Pour lancer Ferret avec les variables d'environnement permettant de se servir de Sibylle, créez un script de lancement à partir des scripts fournis (Sibylle/exferret ou Sibylle/exferret_bash si votre shell courant $SHELL est bash) que vous déplacerez, par exemple, dans votre répertoire ~/bin (répertoire compris dans votre PATH).

Sur les stations et tx, dans ce script exferret, modifier la chaîne de caractères _your_Ferret_path_ par /usr/local/ferret541/paths/ferret_paths et la chaîne de caractères _your_Sibylle_path_ par /home/evian/eric/Sibylle.

Sur les PC, modifier la chaîne de caractères _your_Ferret_path_ par /usr/local/ferret551/paths/ferret_paths et la chaîne de caractères _your_Sibylle_path_ par /home/evian/eric/Sibylle.

Sur la machine de calcul imhotep, modifier la chaîne de caractères _your_Ferret_path_ par /usr/local/ferret541/paths/ferret_paths et la chaîne de caractères _your_Sibylle_path_ par /home/globc_varia/varia/maisonna/Sibylle.


Palettes: 

Quatre palettes créées au Cerfacs sont disponibles en plus des palettes standard de Ferret. Pour des tracés "centrés", utiliser les deux dernières palettes
 
 
Palette "caramel_bleu"
Palette "caramel_mauve"
Palette "caramel_bleu_ctr"
Palette "caramel_mauve_ctr"

Utilisation:   "PALETTE caramel_bleu" ou "PALETTE caramel_mauve"
 

Scripts:

Liste des scripts actuellement disponibles


Initialisation des paramètres de grille:

ORCA
 ini_orca.jnl
Arpege
 ini_arpege.jnl
Medias (Arpege étiré)
 ini_medias.jnl
 

Visualisation grilles 2D:


Grille globale Projection orthographique Projection verticale Projection polaire 
ORCA plot_orca.jnl plot_orca_ortho.jnl plot_orca_verti.jnl
Arpege AT_42 plot_at42.jnl plot_at42_ortho.jnl plot_at42_verti.jnl plot_at42_polar.jnl
Arpege BT_42 plot_bt42.jnl plot_bt42_ortho.jnl plot_bt42_verti.jnl plot_bt42_polar.jnl
Medias plot_medias_globale.jnl
plot_medias_europe.jnl 
plot_medias_france.jnl 


 

Visualisation vecteur 2D:


Grille globale
 Projection polaire
ORCA
 vector_orca.jnl
Arpege AT_42
 vector_at42.jnl
 vector_at42_polar.jnl
Arpege BT_42
 vector_bt42.jnl
 vector_bt42_polar.jnl
Medias
 vector_medias_france.jnl



Interpolation grilles 2D:



 Grille globale
Arpege BT_42 
 interp_bt42.jnl
Medias
 interp_medias_globale.jnl
interp_medias_nord_atl.jnl
 

Autres scripts de visualisation:

Diagramme T_S
 plot_T_S.jnl
Tracé d'iso-surfaces
 projection_iso.jnl
Tracé d'EOF (pour sorties Statpack)
 plot_eof.jnl
Tracé d'une analyse en ondelette
 wavelet.jnl

 

Scripts de mise en forme graphique:

Titres
 titre.jnl ,
titre_sur.jnl, 

titre_sous.jnl

Redéfinition des sous-fenêtres (view)
 vues.jnl
Logo du Cerfacs
 logo_cerfacs.jnl
Superposition du maillage:
grille ORCA/grille Arpege
 grid_orca.jnl
grid_at42.jnl
Création de fonds de cartes
 make_sland.jnl

Superposition de fonds de cartes
 sland.jnl

Ajustement des min/max à une palette de couleurs symétriques par rapport à un zéro
 sym_palette.jnl
Conversion fichier metafile.plt en postscript
 meta2ps.jnl

Axes d'ordonnées droit et gauche
 axe_droit.jnl,

axe_gauche.jnl

 


Scripts de calculs:

Anomalies
 anomalie.jnl
Densités
 densites_orca.jnl
Intégrale volumique
 integrale_volume.jnl




Description fonctionnelle

anomalie.jnl:

Fonction:      Calculer la moyenne d'un champ d'un fichier donné ainsi que l'anomalie à cette climatologie. Retourner ces deux valeurs dans deux variables ferret

ENTREE:
 Argument1 : Nom du champ 2D ou 3D
SORTIE:
 Variables  anomalie_$Champ et climatologie_$Champ

Exemple:         GO anomalie SOSSTSST
Précautions d'usage:  ne rien spécifier entre crochets [] dans l'argument 1 "Champ" (calcul pour tout i,j,k et l). Pour réduire les calculs à des domaines, utiliser la fonction "set region".
 
 
 

axe_droit.jnl, axe_gauche.jnl

Fonction:      Visualiser deux courbes d'ordonnées différentes sur un même graphique

ENTREE:
 Argument1 : Nom du champ 1D ...

Exemple:    SET REGION/L=0:200
                   GO axe_gauche IICETHIC
                   GO axe_droit ISNOWTHI/1000
Remarque: .les fonctions axe_droit et axe_gauche ont les mêmes arguments que les scripts ferret right_axis_plot et left_axis_plot concernant les labels, couleurs, etc ...
 
 
 

densites_orca.jnl:

Fonction:      A partir des temperature et salinités en sortie du modèle OPA, calculer la densité in-situ et potentielle selon deux méthodes. Retourner ces trois valeurs dans des variables ferret



ENTREE:
 Pas d'argument. Un fichier ORCA contenant salinités et températures doit cependant avoir été chargé au préalable.
SORTIE:
 Variables  densite_in_situ, masse_vol_potentielle et densite_ferret

Exemple:         GO densites_orca
 
 
 

ini_arpege.jnl

Fonction:      Charger des fichiers de grille et de masque de la grille ARPEGE pour visualisation

Cette fonction charge ("use" ferret) les fichiers de grilles (grids.des) et de masques (masks.des) des grilles des modèles Orca et Arpege et pré-définit de nouvelles variables (latitudes, longitudes, masques) utilisées dans les scripts de classe "plot_" et "vector_".

Ces fichiers sont localisés dans le répertoire $FER_DATA.

La plupart des fonctions de visualisation de notre bibliothèque charge et décharge ces données automatiquement. L'utilisateur n'a donc pas à lancer cette commande dans le cas d'une utilisation standard des outils SIBYLLE.


ENTREE:
 pas d'argument
SORTIE:
 Variable new sur la grille AT42_GRID

Exemple:          GO ini_arpege
Remarque: les grilles sont chargées, mais le fichier de données par défaut n'est pas modifié par le lancement de la commande. Pour utiliser les champs des fichiers grids.des et masks.des, utiliser l'option [d=masks] ou [d=grids] à chaque appel d'un champ de masque ou de grille.
Le déchargement des fichiers de données peut se faire en lancant les commandes: "cancel data masks" et "cancel data grids"
 
 
 
 

ini_orca.jnl

Fonction: Charger des fichiers de grille et de masque de la grille ORCA pour visualisation

voir "ini_arpege.jnl"


ENTREE:
 pas d'argument
SORTIE:
 Variables lon2,lat2: tableaux 2D (182x149) des longitudes et latitudes de chaque point de la grille ORCA, modifiées pour visualisation.
Variable masquée TORC_MSK[d=masks]

Exemple:          GO ini_orca
Remarque: voir ini_arpege.jnl.
La variable TORC_MSK est un masque terre qui peut être appliqué à un champ ORCA ne contenant pas de masque (fichier de forçage, résultat d'interpolation, grille Levitus ...). Pour cela, on visualisera le champ "CHAMP+TORC_MSK[d=masks]".
 
 
 

ini_medias.jnl

Fonction: Charger des fichiers de grille et de masque de la grille MEDIAS pour interpolation et des grilles régulières 1 degrés, 0.5 degrés et 0.1 degrés pour visualisation
voir "ini_arpege.jnl"


ENTREE:
 pas d'argument
SORTIE:
 Variables lon_xxxx,lat_xxxx[d=reg_grids]: tableaux 2D des longitudes et latitudes de chaque point des  grilles regulières (avec xxxx=1010 pour la grille 1 degrés, 0505 pour la grille 0.5 degrés et 0101 pour la grille 0.1 degrés)
Variables MEGL_LON, MEGL_LAT, MEFR_LON, MEFR_LAT[d=grids]: tableaux 2D des longitudes et latitudes de chaque point des  grilles MEDIAS (complète (sur 21692 points) et réduite sur la France (sur 360 points))
Variable masquée MEGL_MSK[d=masks]. La grille MEDIAS sur 360 points ne compte que des points non masqués
Variable new_xxxx sur la grille  regulière xxxx

Exemple:          GO ini_medias
Remarque: voir ini_arpege.jnl.
La variable MEGL_MSK est un masque terre qui peut être appliqué à un champ MEDIAS global ne contenant pas de masque. Pour cela, on visualisera le champ "CHAMP+MEGL_MSK[d=masks]".
 
 

integrale_volume.jnl

Fonction: calcul de l'intégrale d'un champ volumique entre deux isosurfaces

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ à intégrer (3D volumique + dimension temporelle éventuelle)
Argument 2: Nom du champ sur lequel se trouvent les isosurfaces (3D volumique + dimension temporelle éventuelle)
Argument 3: Valeur de l'isosurface inférieure
Argument 4: Valeur de l'isosurface supérieure
SORTIE:
 fichier int_vol.nc, variable: vol_field

Exemple:          GO integrale_volume  VOTEMPER VORHOPOT 1024 1025.5

Dans cet exemple, on calcule une champ 2D + dimension temporelle, nommé "vol_field", contenu dans un fichier int_vol.nc. Ce champ représente l'évolution temporelle de l'intégrale de la température dans un volume compris entre l'isopycne 1024 et l'isopycne 1025.5.

Remarque: les calculs étant un peu longs, une réduction du domaine de calcul est recommandée. On spécifiera les limites dans la variable "champ à integrer", la limitation se faisant alors automatiquement sur le champ des isosurfaces.
Exemple: GO integrale_volume  VOTEMPER[i=50:60,j=30:40] VORHOPOT 1024 1025.5
 
 
 

interp_bt42.jnl, inter_medias_globale.jnl, interp_medias_nord_atl.jnl

Fonction:       interpolation de champs 2D + dimension temporelle sur une grille réguliere

Les champs des grilles réduites et stretchées Arpege peuvent être visualisées par l'intermédiaire des scripts plot_bt42 et plot_medias. Mais on ne peut visualiser qu'une échéance temporelle à la fois et la manipulation de champs provenant de plusieurs échéances temporelles est parfois problématique.
Les fonctions "interp" offrent donc la possibilité d'interpoler l'ensemble d'un fichier netcdf 2D+dimension temporelle dans un fichier nommé a_interp.nc ou a_trian.nc, sur une grille régulière:

grille régulière AT42 Arpege pour interp_bt42
grille régulière globale 1degré x 1degré pour interp_medias_globale
grille régulière réduite à l'Atlantique Nord 0.5 degrés x 0.5 degrés pour interp_medias_nord_atl

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ à interpoler (2D surfacique + dimension temporelle éventuelle)
SORTIE:
 fichier a_interp.nc ou a_trian.nc, variable: a_interp ou a_trian

Exemple:        GO interp_medias_nord_atl PLMEASLP
                        SHADE a_trian[l=@ave]
 
 
 

grid_orca.jnl

Fonction: Superposer à un champ ORCA le maillage de la grille
 
ENTREE:
 Argument 1: Step (dessiner le maillage tous les "step" points de grille) (par défaut: 5)

Exemple:          GO   grid_orca   1
Remarque: Grille T seulement.  Ne fonctionne qu'en projection non polaire. 

 
 
 

grid_at42.jnl

Fonction: Superposer à un champ "Arpege régulier" le maillage de la grille.
 
ENTREE:
 Argument 1: Step (dessiner le maillage tous les "step" points de grille) (par défaut: 5)

Exemple:          GO   grid_at42   1

Remarque: Ne fonctionne qu'en projection non polaire.
 
 
 

logo_cerfacs.jnl


Fonction: Faire apparaître le logo du cerfacs (coin supérieur droit) sur un graphe


ENTREE:
 pas d'argument. Utilise le fichier logo_cerfacs.nc et la palette cerfacs.spk
SORTIE:
 Variable définissant une zone de fenêtre (view) : LogoR

Exemple:           GO logo_cerfacs
Précautions d'usage: Lancer cette commande avant toute commande de définition de vue ("set view").
Remarque: Pour créer un nouveau logo, utiliser la fonction /home/dasp/maisonna/ferret/predicate/New_scripts/mak_logo.jnl
 
 
 

make_sland.jnl

Fonction: Créer des fonds de carte à superposer dans les visualisations 2D

Sur le site Web http://rimmer.ngdc.noaa.gov/mgg/coast/getcoast.html, on peut sélectionner une région du globe et télécharger le fichier ASCII de traits de côtes correspondant. Le programme make_sland permet de convertir ce fichier au format Sibylle pour qu'il puisse être visualisé via la fonction sland.jnl.

ENTREE:
 Argument 1: nom du fichier ASCII de traits de côtes
SORTIE:
 Fichier .sib à copier

Exemple:          GO make_sland   egee.dat
Remarque: Le fichier .sib obtenu doit être copié dans le répertoire $FER_SIBYLLE/Data pour être toujours trouvé par le script sland.jnl.
 
 
 

meta2ps.jnl

Fonction:   Transformer le fichier metafile.plt en un fichier postscript

ENTREE:
 Argument 1: nom du fichier postscript
Argument 2: format Portrait (P) ou Paysage (L)
SORTIE:
 Fichier .sib à copier

Exemple:          GO meta2ps   egee.ps  L
Remarque: Le fichier metafile s'obtient toujours en entourant les lignes de commandes Ferret de tracé par les commandes "set mode metafile" et "cancel mode metafile". On peut également, sans passer par le format postscript et en une seule commande, produire un fichier .gif de la figure qui se trouve à l'écran:   FRAME/file=fichier.gif
 
 

plot_at42.jnl

Fonction: Visualiser un champ at42 (2D) en projection globale

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: shade)
Argument 3: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:         GO   plot_at42   PLZOW200[L=1]   fill/line   TERRE
Remarque:  
 
 

plot_at42_ortho.jnl et plot_at42_verti.jnl

Fonction:Visualiser un champ at42 (2D) en projection orthographique ou verticale

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2: Parallèle central (par défaut : 90 -pole Nord-)
Argument 3: Méridien Central (par défaut : 0 -Greenwich-)
Argument 4: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: shade)
Argument 5: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:         GO   plot_at42_ortho   PLZOW200[L=1]  -40     80    fill/line   TERRE

Remarques:

 
 
 

plot_at42_polar.jnl

Fonction: Visualiser un champ at42 (2D) en projection polaire équidistante

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2: Pôle Nord (N) ou Sud (S)  (par défaut : N-pôle Nord-)
Argument 3: Méridien Central (entr e-180 et 180) (par défaut : 0 -Greenwich-)
Argument 4: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: shade)
Argument 5: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:  GO   plot_at42_polar   PLZOW200[L=1]    N    80    fill/line   TERRE
Remarques:  
 
 

plot_bt42.jnl

Fonction:Visualiser un champ bt42 (2D) en projection globale

Ce script procède à une projection du vecteur 1D de 6232 points de la grille BT42 sur les points de la grille AT42 (fonction ferret scat2gridgauss_XY).
Sur les bandes de latitude élevée, certains points de la grille AT42 ne sont pas remplis par des valeurs de la grille BT42. On effectue donc une deuxième interpolation, linéaire et suivant X (commande let trace = samplebt[i=@fln]).
L'interpolation scat2gridgauss_XY ne tient pas compte de l'option [l=...] fixant la coordonnée temporelle. On décale donc les données d'entrée à l'aide de l'option [L=@shf:($echeance)] ou $echeance est fixée par l'utilisateur en troisième argument de la fonction.


ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: shade)
Argument 3: Coordonnée temporelle (par défaut L=1)
Argument 4: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:            GO   plot_bt42   COWATFLU   fill/line   5   TERRE
Remarque:  
 

plot_bt42_ortho.jnl et plot_bt42_verti.jnl

Fonction:Visualiser un champ bt42 (2D) en projection orthographique ou verticale

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2: Parallèle central (par défaut : 90 -pôle Nord-)
Argument 3: Méridien Central (par défaut : 0 -Greenwich-)
Argument 4: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: shade)
Argument 5: Coordonnée temporelle (par défaut L=1)
Argument 6: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:            GO   plot_bt42_ortho   COWATFLU   90   70   shade/line   5   MER
Remarques:  
 
 

plot_bt42_polar.jnl

Fonction: Visualiser un champ bt42 (2D) en projection polaire équidistante

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2: Pôle Nord (N) ou Sud (S)  (par defaut : N-pôle Nord-)
Argument 3: Méridien Central (entre -180 et 180) (par défaut : 0 -Greenwich-)
Argument 4: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: shade)
Argument 5: Coordonnée temporelle (par défaut L=1)
Argument 6: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:            GO   plot_bt42_polar   SISUTESU   N   -90   shade/line   5   TERRE
 
Remarques:  
 
 

plot_eof.jnl

Fonction: Visualiser deux modes EOF  (pattern + composantes principales) d'un fichier de sortie de Statpack.
Le pourcentage de variance expliquée par chaque mode est également affiché (en titre du graphe des composantes principales)

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2:  Numéro du premier mode à visualiser (defaut:1)
Argument 3:  Numéro du second mode à visualiser (defaut:1)
Argument 4: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: plot_orca)

Exemple:              GO   plot_eof   SOSSTSST   1   2    fill
 
 
 

plot_medias_globale.jnl, plot_medias_europe.jnl et plot_medias_france.jnl

Fonction:Visualiser un champ medias (2D) en projection globale

Le script plot_medias_france permet de visualiser les 360 points de la grille Medias France en les interpolant sur une grille régulière 0.1 degrés.
Les deux autres scripts permettent de visualiser les champs de la grille complète Medias (Arpege étiré) en l'interpolant soit sur une grille de 0.5 degrés de côté (pour une visualisation sur l'Europe) ou sur une grille de 1 degré de côté (pour une vue plus globale).
Ces scripts utilisent la fonction Ferret scat2gridgauss_XY (voir plot_bt42.jnl)
Sur la visualisation globale, deux interpolations linéaires sont faites suivant les axes I et J.
 
ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: shade)
Argument 3: Coordonnée temporelle (par défaut L=1)
Argument 4 (pour plot_medias_globale et plot_medias_europe seulement) : Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE
(par défaut: NONMASQUE)

Exemple1:            GO   plot_medias_globale SUTOPRSU   shade   1
Exemple2:            GO   plot_medias_europe  SUTOPRSU   shade   1   TERRE
Exemple3:            GO   plot_medias_france   SITEMPCL    fill  1
 
 
 

plot_orca.jnl

Fonction: Visualiser un champ ORCA (2D)  en projection globale
 
ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: shade)

Exemple:              GO   plot_orca   SOSSTSST[L=1]   fill/line
Remarques:  
 
 

plot_orca_ortho.jnl et plot_orca_verti.jnl

Fonction:Visualiser un champ ORCA (2D) en projection orthographique ou verticale

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ
Argument 2: Parallèle central (par défaut : 90 -pôle Nord-)
Argument 3: Méridien Central (par défaut : 0 -Greenwich-)
Argument 4: Commande du plot avec option (ex: shade/line/levels ) (par défaut: shade)

Exemple:             GO   plot_orca_ortho   SOSSTSST[L=1]   90   70   fill/line

Remarques:

 
 
 

plot_T_S.jnl

Fonction: Tracé d'un diagramme T/S

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ de température
Argument 2: Nom du champ de salinité
Argument 3: Argument de la  commande plot (par défaut: nolab)

Exemple:  GO   plot_T_S
                                                SOSSTSST[i=114:120@ave,j=114:120@ave]
                                                SOSALINE[i=114:120@ave,j=114:120@ave]
                                                pen=3
Remarque:  
 
 

projection_iso.jnl

Fonction: Projection d'un champ ORCA 3D sur l'iso-surface d'un autre

ENTREE:
 Argument 1:  Nom du champ à projeter
Argument 2: Nom du champ sur lequel projeter
Argument 3: Valeur définissant l'iso-surface sur laquelle projeter le premier champ
Argument 4:  Argument de la  commande plot (par défaut: shade)

Exemple:          GO     projection_iso    VOTEMPER[L=1]   VOSALINE[L=1]    35    fill
Remarques:  
 
 

sland.jnl

Fonction:          Faire apparaître le contour des continents sur une visualisation d'un champ 2D

Utilisé avec l'argument "orca", la fonction sland superpose un fond de carte global à la grille ORCA.
La fonction standard "land" superpose le contour des continents sur une plage de longitude allant de -180 à 750 degrés.
La grille ORCA commencant à -275 degrés, le script "land.jnl" d'origine a été transformé: les contours des continents ont été translatés de -360 degrés.

Cette fonction permet également de visualiser les fonds de cartes créés avec la fonction make_sland.jnl. On donne alors comme argument à la fonction le nom du fichier .sib correspondant (sans l'extension .sib).

Avec l'argument "list", la fonction renvoie l'ensemble des fonds de cartes disponibles dans le répertoire $FER_SIBYLLE/Data.

ENTREE:
 Argument 1:  
  • "orca" pour superposer un fond de carte global à un champ ORCA
  • "nom_fond_de_carte_Sibylle" pour superposer un fond de carte créé avec make_sland.jnl
  • "list" pour lister les différents fonds de carte Sibylle disponibles
Argument 2: "overlay" (superposition) ou "basemap"  (carte de fond)
Argument 3:  (avec argument 1 "orca" seulement) Couleur des contours des pays
Argument 4:  (avec argument 1 "orca" seulement) Couleur des contours des états d'un certain pays ... mais lequel ? A toi de trouver, petit ami !


Exemple:          GO   sland   iroise   basemap
 
 
 

sym_palette.jnl

Fonction: Ajustement symétrique d'une palette par rapport à zéro ou à un niveau donné

Pour séparer, de façon immédiatement lisible, les valeurs d'un champ 2D en deux parties distinctes (par exemple la partie négative de la partie positive), on utilise une palette de couleurs symètriques. Par exemple, pour la palette Sibylle "caramel_bleu", des teintes rouges colorent la partie positive, des bleues la partie négative.
La fonction sym_palette permet de centrer la palette autour d'un zéro (0 ou valeur fixée par l'utilisateur).

ENTREE:
 Argument 1: Champ
Argument 2: Valeur du niveau "zéro"

Exemple:                          GO    sym_palette    SOSSHEIG[l=1]              (définition des nouveaux niveaux de la palette)
                         puis          SET view full                                                    (définition de la vue du tracé)
                         puis          SHADE/lev   SOSSHEIG[l=1]                         (utilisation des nouveaux niveaux dans la commande de tracé)
Remarque:  
 
 

titre.jnl, titre_sur.jnl, titre_sous.jnl

Fonction:              Ajouter d'un titre à un graphique

Ce graphique doit avoir été composé avec une commande comprenant l'option  /nolabel, ce qui est le cas de toutes les commandes de visualisation SIBYLLE. Ce script utilise la commande ferret "label" en recalculant la position en X et en fixant la position Y (-.7), le mode de justification (0, centrée), l'angle (0, horizontal) et la taille (.2 pouces). 

"titre_sous.jnl" fixe, lui, la position en Y à un cinquième de la taille totale du graphique en dessous de celui-ci (même option que titre.jnl).

"titre_sur.jnl" permet quand à lui de placer au dessus du graphique un titre et, éventuellement, un sous titre.

ENTREE:
 Argument 1: Chaîne de caractère du titre
Argument 2: Taille de la chaîne (défaut: 0.2)
Argument 3 (pour titre_sur seulement): Chaîne de caractère du sous-titre
Argument 4: Taille de la chaîne sous-titre (défaut: 0.2)

Exemple:                GO   titre   "Précipitations totales"
Remarque:  
 
 

vector_at42.jnl

Fonction:          Visualiser un champ de vecteurs at42 (2D) en projection globale

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ zonal
Argument 2: Nom du champ méridien
Argument 3: Argument de la  commande vector (ex:  aspect) (par défaut: nolabel)
Argument 4: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:         GO   vector_at42   PLZOW200   PLMEW200   overlay/l=1   TERRE
Remarque:  
 
 

vector_at42_polar.jnl

Fonction:            Visualiser un champ de vecteurs at42 (2D) en projection polaire équidistante

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ zonal
Argument 2: Nom du champ méridien
Argument 3: Pôle Nord (N) ou Sud (S)  (par défaut : N-pôle Nord-)
Argument 4: Méridien Central (entre -180 et 180) (par défaut : 0 -Greenwich-)
Argument 5: Argument de la  commande vector (ex:  aspect) (par défaut: nolabel)
Argument 6: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:           GO   vector_at42_polar   PLZOW200   PLMEW200   S   70   aspect/L=1   TERRE
Remarque:  
 
 

vector_bt42.jnl

Fonction:             Visualiser un champ de vecteurs bt42 (2D) en projection globale

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ zonal
Argument 2: Nom du champ méridien
Argument 3: Argument de la  commande vector (ex:  aspect) (par défaut: nolabel)
Argument 4: Coordonnée temporelle (par défaut L=1)
Argument 5: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:            GO   vector_bt42   SIZOWICL   SIMEWICL   aspect   120   TERRE
Remarque:  
 
 

vector_bt42_polar.jnl

Fonction:          Visualiser un champ de vecteurs at42 (2D) en projection polaire équidistante

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ zonal
Argument 2: Nom du champ méridien
Argument 3: Pôle Nord (N) ou Sud (S)  (par défaut : N-pole Nord-)
Argument 4: Méridien Central (entre -180 et 180) (par défaut : 0 -Greenwich-)
Argument 5: Argument de la  commande vector (ex:  aspect) (par défaut: nolabel)
Argument 6: Coordonnée temporelle (par défaut L=1)
Argument 7: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:          GO   vector_bt42_polar   SIZOWICL   SIMEWICL   S   90   noaxis   30   TERRE
Remarques:  
 
 

vector_medias_france.jnl

Fonction:          Visualiser un champ de vecteurs Medias (2D) en projection centrée sur la France

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ zonal
Argument 2: Nom du champ méridien
Argument 3: Argument de la  commande vector (ex:  aspect) (par défaut: nolabel)
Argument 4: Coordonnée temporelle (par défaut L=1)
Argument 5: Masque: TERRE ou MER ou NONMASQUE (par défaut: NONMASQUE)

Exemple:            GO vector_medias_france   SIZOWICL  SIMEWICL    aspect   120
 
 
 

vector_orca.jnl

Fonction:         Visualiser un champ de vecteurs ORCA (2D) en projection globale

ENTREE:
 Argument 1: Nom du champ zonal
Argument 2: Nom du champ méridien
Argument 3: Argument de la  commande vector (ex:  aspect) (par défaut: nolabel)

Exemple:            GO   vector_orca   SOZOTAUX[d=1]   SOMETAUY[d=2]  aspect/L=1

Remarques:  
 
 

vues.jnl

Fonction:          Définir de nouvelles zones de fenêtres (view)

Ces nouvelles vues permettent de mieux utiliser l'espace de la fenêtre avec des graphiques sans labels. L'appel préalable à ces fonctions de définitions de vues est donc fortement conseillé avec l'utilisation des fonctions de visualisation de la librairie SIBYLLE.

ENTREE:
 Argument 1: Nombre de vues par colonne (entre 2 et 4)
Argument 2: Nombre de vues par ligne (entre 1 et 2)
Argument 3: Orientation (portrait (P) ou paysage (L))
SORTIE:
 Variables définissant une zone de fenêtre (view) : v[1-8]

Exemple:           GO    vues   3   2    P  
 
 
 

wavelet.jnl

Fonction:       Calculer et afficher une analyse en ondelettes sur une série temporelle 1D.

La description complète de cette fonction se trouve sur le site: http://paos.colorado.edu/research/wavelets/


ENTREE:
 Argument 1: Nom de la variable 1D temporelle
Argument 2: Chaîne de caractères du titre (défaut: "Variable (Argument 1)")
Argument 3: Comparaison du spectre avec un bruit rouge ou un bruit blanc (defaut: rouge)
Argument 4: Pas de l'échantillonnage (période de la série temporelle) (défaut: 1)
Argument 5: Echelle minimum de l'ondelette (défaut: pas * 2)
Argument 6: Ondelette mère:  0= Morlet  (défaut), 1= Paul, 2= DOG (Derivative Of Gaussian)
Argument 7: Paramètre de l'ondelette mère:
Pour Morlet, k0 (nombre d'onde), (défaut: 6)
For  Paul, m (ordre), (défaut: 4)
For  DOG , m (dérivée m-ieme), (défaut: 2)
Argument 8: Deuxième Champ 1D (défaut: aucun)
Argument 9: Titre du deuxième champ (défaut: aucun)
Argument 10: Comparaison du spectre avec un bruit rouge ou un bruit blanc (défaut: rouge)

Exemple:           GO    wavelet   nino3_index




Remarques générales

Concernant tous les scripts de visualisation


ARGUMENTS:
Pour donner à un de ces scripts un argument qui ne serait pas le premier, l'utilisateur doit spécifier TOUS les arguments précédents ou les remplacer par un espace entouré de deux guillements: " ".
 

USE:
Ces scripts s'utilisent comme des commandes shade ou vector. Les fichiers de données doivent être chargés avant lancement des commandes.
Les numéros de fichiers de données ne sont pas modifiés par l'appel de ces commandes.
 

LOGO:
Le logo du Cerfacs peut être inséré en haut à droite du graphique par le lancement de la commande "go logo_cerfacs".
 

LABELS:
Les graphiques apparaissent sans label, sans axes et sans titres.
 

TITRES:
Un titre peut être ajouté après exécution d'une commande de visualisation par le lancement du script "titre.jnl".
 

CONTINENTS:
Pour les visualisations en projection non polaires, les contours des continents peuvent être ajoutés par le lancement de la commande "go land" (ou "go land_east" pour la grille Orca).
Des continents grisés peuvent être ajoutés par le lancement de la commande "fland.jnl".
 

ZOOM:
Pour zoomer, utiliser les options /xlim=longitude_min:longitude_max et /ylim=latitude_min:latitude_max dans l'argument "Commande du plot" (ou délimiter des aires géographiques par défaut: "set region"). En règle générale, pour les 3 types de grille, ne pas chercher à fixer des limites géographiques avec les options [I=...,J=...].
Pour zoomer sur des régions à cheval sur le méridien de Greenwich, sur une grille AT42, vérifier que la variable longitude (1D) de votre fichier de données comporte bien l'attribut "modulo".
 
 
 

Concernant les scripts de type *_polar.jnl

DROITS D'ECRITURE:
Ces scripts de visualisation en projection polaire utilisent des scripts de base "Ferret" polar_2d.jnl ou polar_vector.jnl. Ces scripts sauvent des fichiers de données contenant les nouvelles coordonnées en projection polaire (polar_grid.dat ou polar_[UV]_points.dat). Pour cela, il est nécessaire de se trouver dans un répertoire où sont ouverts les droits en écriture lors du lancement de Ferret. A noter que ces fichiers de coordonnées sont ré-utilisables (l'utilisateur peut se passer de l'exécution du script SIBYLLE et lancer directement la commande polar_2d.jnl ou polar_vector.jnl).
Cette remarque s'applique également aux scripts d'interpolation, de création de fond de carte, de calcul d'intégrale ou d'analyses en ondelettes.
 

CONTINENTS, CONTOUR DES GRILLES EN PROJECTION POLAIRE:
Sur le graphe en projection polaire, on pourra superposer des contours de continent (polar_land.jnl), des continents grisés (polar_fland.jnl) ou des grilles de latitude - longitude (polar_grid_fancy.jnl). Pour la syntaxe de ces scripts, voir leur entête dans le répertoire$FER_GO (voir le script exferret).
 
 
 

Concernant les scripts de type *_verti.jnl

DISTANCE VERTICALE:
La distance verticale est fixée à 7000Km. Pour la changer, changer la valeur "7000" à la ligne
          go   mp_vertical_at42     $3"0"    $2"90"    7000
ou
          go   mp_vertical_orca     $3"0"    $2"90" 7000
 
 
 

Concernant les scripts de type *_ortho.jnl ou *_verti.jnl

CONTINENTS EN PROJECTION ORTHO OU VERTICALE:
L'ajout de lignes de grilles ou de continents n'est pas possible avec les scripts standard "graticule.jnl" et "land.jnl" ou "fland.jnl". Pour masquer les continents, utiliser l'argument "Masque" de votre script SIBYLLE. Essayer aussi le script "mp_land.jnl".
 
 
 

Concernant ls scripts de type *_orca.jnl

MASQUES:
Pour masquer un champ, il n'existe pas d'argument spécifique.La variable TORC_MSK est un masque terre qui peut être appliqué à un champ ORCA ne contenant pas de masque (fichier de forçage, résultat d'interpolation, grille Levitus ...). Pour cela, on visualisera le champ "CHAMP+TORC_MSK[d=masks]".  
 

ZOOM:
Les zooms à cheval sur la ligne de recouvrement Ouest-Est (océan Indien) ne sont pas possible à l'aide de ce script (voir projection de la grille ORCA sur une grille regulière, scripts en préparation). Dans les autres cas, utiliser l'option /xlim ou /ylim avec des longitudes ou des latitudes négatives/positives (ex: /xlim=-100:10/ylim=-10:60 pour le Nord de l'Atlantique).
 
 
 

Concernant les scripts de visualisation de grilles Arpege:

DIMENSION TEMPORELLE:
Pour la grille régulière AT42: Penser à fixer la dimension temporelle pour les fichiers contenant plusieurs échéances
ex:               go   plot_at42   PLZOW200[L=1]
ou bien             go   plot_at42   PLZOW200    fill/L=1

Pour la grille réduite BT42: Ne pas chercher à passer l'option [L=...] avec le nom du champ, ni l'option [L=@shf:...]. Cet inconvénient disparaît à l'utilisation du script d'interpolation "interp_bt42.jnl".