Data management at CECI UMR 5318
Plan du Cerfacs
Machines de l'équipe
Document excel avec les machines de l'équipe
Comptes
La commande rquota -f affiche les quotas des membres du groupe globcs (~ globc)
Gestion MAC
Achat MAC complet: Mac avec adaptateur de charge et cable, Housse, Disque dur externe, Pack Office, adaptateur hdmi (3 entrees), ethernet, adaptateur vga (3 entrées), souris + eventuellement un clavier externe et/ou un ecran (il y en a au Cerfacs pour connecter le MAC mais necessaire si teletravail).
Logiciels
http://intranet.cerfacs.fr/intranet_equipes/csg/index.php?id=logiciels
Commande setfacl
La commande getfacl permet de voir les permissions positionnées:
getfacl /scratch/globc/dcom/CMIP6 /scratch/globc/dcom/PRIMAVERA /scratch/globc/dcom/CMIP6_TOOLS/
getfacl /scratch/globc/dcom/CMIP6
getfacl: Removing leading '/' from absolute path names
# file: scratch/globc/dcom/CMIP6
# owner: coquart
# group: globc
user::rwx
user:cabrera:r-x
user:datamg:r-x
user:coquart:rwx
user:moine:rwx
user:msadek:rwx
user:mmrey:rwx
group::r-x
mask::rwx
other::r-x
La commande setfacl permet au detenteur du repertoire (ci dessus coquart) d'ajouter des droits :
setfacl -Rm u:msadek:rwx /scratch/globc/dcom/CMIP6/
La commande setfacl permet aussi au detenteur d'effacer quelqu'un:
setfacl -R -x u:bessieres /scratch/globc/dcom/CMIP6/PAMIP
Si on cree un sous repertoire a un repertoire sur lequel on a fait un setfacl, il faut redonner les droits rwx a tous ceux qui les avaient.
Scylla
ssh -X scylla@cerfacs.fr
En batch:
sur prod (va sur le noeud gsa2 par defaut, ajouter #SBATCH -w gsa3 ou #SBATCH -w gsa4 pour changer de noeud) : sbatch batch_job_scylla_prod
sur bigmem : sbatch batch_job_scylla_bigmem
Commandes SLURM utiles:
squeue : donne la liste de la totalité des jobs en attente et actifs
squeue -j JOBID : donne le statut d'un job (JOBID est le numéro du job)
squeue -u $USER : donne la liste des jobs de l'utilisateur $USER
En interactif:
salloc -w gsa3 ; ssh gsa3 ; ncl script.ncl
exit ; exit
NICE sur scylla (via firefox)
http://scylla.cerfacs.fr:8080/enginframe/vdi/vdi.xml?_uri=//com.enginframe.interactive/list.sessions
Machines de Météo france
Heures consommees sur beaufix:
/opt/softs/bin/sccompta -m beaufix -a cglo
/opt/softs/bin/sccompta -m beaufix -a cgie
/opt/softs/bin/sccompta -m beaufix -a cgie -l libre
Espace occupe sur Hendrix:
acct -v -g
acct -g
acct
Comptes sur Beaufix :
ls -al /home/ext/cf/cglo
drwxr-xr-x 24 root root 4096 Feb 18 10:24 .
drwxr-xr-x 9 root root 4096 Mar 13 2019 ..
drwxr-xr-x 11 56166 cglo 4096 Jan 21 09:12 bessieresl
drwxr-xr-x 12 cassouc cglo 4096 Feb 13 16:49 cassouc
drwxr-xr-x 10 chripkos cglo 4096 Feb 18 15:01 chripkos
drwxr-xr-x 4 colmeta cglo 4096 Aug 27 2015 colmeta
drwxr-xr-x 19 coquartl cglo 32768 Feb 13 08:58 coquartl
drwxr-xr-x 16 craiga cglo 4096 Oct 17 18:14 craiga
drwxr-xr-x 13 jaravelt cglo 4096 Jan 10 14:36 jaravelt
drwxr-xr-x 21 jonvilleg cglo 12288 Jan 28 14:50 jonvilleg
drwxr-xr-x 4 linea cglo 4096 Nov 27 10:04 linea
drwxr-xr-x 9 lopezparagesj cglo 4096 Mar 11 2019 lopezparagesj
drwxr-xr-x 14 maisonnavee cglo 4096 Feb 13 09:16 maisonnavee
drwxr-xr-x 9 56203 cglo 4096 Jan 21 09:26 martindelreym
drwxr-xr-x 20 moinemp cglo 4096 Jan 28 15:40 moinemp
drwxr-xr-x 10 msadekr cglo 4096 Feb 19 09:18 msadekr
drwxr-xr-x 17 pagec cglo 4096 Jan 14 13:37 pagec
drwxr-xr-x 11 peatiers cglo 4096 Feb 19 09:37 peatiers
drwxr-xr-x 10 rousseauv cglo 4096 Nov 7 08:56 rousseauv
drwxr-xr-x 34 sancheze cglo 12288 Feb 18 16:33 sancheze
drwxr-xr-x 13 sandersonb cglo 4096 Jan 21 14:53 sandersonb
drwxr-xr-x 8 terrayl cglo 4096 Nov 21 2018 terrayl
drwxr-xr-x 4 tiberial cglo 4096 Mar 28 2018 tiberial
drwxr-xr-x 44 valckes cglo 8192 Feb 10 08:21 valckes
Comptes sur Hendrix :
ls -al /exterieurs/cglo/
drwxr-xr-x 31 root cglo 512 Jan 17 14:31 .
drwxr-xr-x 27 root root 512 Feb 13 2018 ..
drwxr-xr-x 169 56093 cglo 3072 Jun 8 2015 badorm
drwxr-xr-x 4 56166 cglo 512 Jul 10 2019 bessieresl
drwxr-xr-x 7 boej cglo 512 Jan 14 08:39 boej
drwxr-xr-x 88 cglo346 cglo 512 Jan 14 08:40 cassouc
drwxr-xr-x 3 56224 cglo 512 Jan 23 2019 castar
drwxr-xr-x 5 chripkos cglo 512 Jul 22 2019 chripkos
drwxr-xr-x 29 coquartl cglo 512 Jan 14 08:40 coquartl
drwxr-xr-x 16 craiga cglo 512 Jul 1 2019 craiga
drwxr-xr-x 12 hamonm cglo 512 Sep 5 2013 hamonm
drwxr-xr-x 2 root root 512 Jul 7 2017 ienm
drwxr-xr-x 6 jonvilleg cglo 512 Jan 17 14:31 jonvilleg
drwxr-xr-x 3 linea cglo 512 Nov 27 10:04 linea
drwxr-xr-x 3 lopezparagesj cglo 512 Feb 15 2019 lopezparagesj
drwxrwxr-x 21 cglo315 cglo 512 Jan 8 09:09 maisonnavee
drwxr-xr-x 3 56220 cglo 512 Jan 15 2019 marquea
drwxr-xr-x 3 56203 cglo 512 Jan 21 09:35 martindelreym
drwxr-xr-x 16 moinemp cglo 512 Jan 14 08:41 moinemp
drwxr-xr-x 3 moinemp-cmems cglo 512 Feb 14 2017 moinemp-cmems
drwxr-xr-x 4 56118 cglo 512 Oct 22 2015 moneriepa
drwxr-xr-x 6 msadekr cglo 512 Dec 2 07:27 msadekr
drwxr-xr-x 12 pagec cglo 512 Jan 14 08:40 pagec
drwxr-xr-x 9 peatiers cglo 512 Feb 3 09:24 peatiers
drwxrwxr-x 23 rogelp cglo 512 Jan 14 08:39 rogelp
drwxr-xr-x 4 rousseauv cglo 512 Dec 2 07:26 rousseauv
drwxr-xr-x 107 sancheze cglo 512 Jan 21 09:34 sancheze
drwxr-xr-x 6 sandersonb cglo 512 Nov 14 13:18 sandersonb
drwxr-xr-x 14 terrayl cglo 512 Jan 14 08:41 terrayl
drwxr-xr-x 3 tiberial cglo 512 Mar 28 2018 tiberial
drwxrwxr-x 12 valckes cglo 512 Jan 14 08:41 valckes
Correspondance cgie (mail du 15 nov 2018) :
ls -al /exterieurs/cgie
- cgie001 : Eric
- cgie002 : Christophe
- cgie003 : Emilia
- cgie004 -> Marta ? car ouvert apres le mail initial envoye par Meteo France
- cgie005 : Marie-Pierre
- cgie006 : Sophie V.
- cgie038 : Laurent Bessieres, utilise par MP, SV
- cgie009 : Laure
CMIP6 Data
Data request : CMIP6 variables available ; http://clipc-services.ceda.ac.uk/dreq/mipVars.html
Convention Nom standard des variables CMIP6
MIP pour CMIP6
Convention CF (Climate and Forecast) pour les MetaData : http://cfconventions.org/
Faire un run CNRM-CM, Stéphane Sénési, 12/06/2018
CMIP5 Data
Nom standard des variables CMIP5
Modèle CNRM-CM5-1 sur nemo_lenovo
Téléchargement noeuds ESGF
Téléchargement de données CMIP :
Il faut d'abord s'inscrire (en haut a droite sur la page d'accueil : Create an account) sur un noeud ESGF, voir le site https://esgf.llnl.gov/nodes.html pour les noeuds existants. L'OpenID, le username et le password sont ensuite valables sur n'importe quel noeud. Pour avoir le status des noeuds https://esgf-node.llnl.gov/status/